Détection de spots avec sélection d’échelle automatique et seuillage adaptatif en microscopie de fluorescence

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dc.contributor.author Basset, Antoine -
dc.contributor.author Boulanger, Jérôme -
dc.contributor.author Bouthemy, Patrick -
dc.contributor.author Kervrann, Charles -
dc.date.accessioned 2019-06-27T13:46:30Z
dc.date.available 2019-06-27T13:46:30Z
dc.date.issued 2015 -
dc.identifier.citation Basset, Antoine ; Boulanger, Jérôme ; Bouthemy, Patrick ; Kervrann, Charles. Détection de spots avec sélection d’échelle automatique et seuillage adaptatif en microscopie de fluorescence. Traitement du signal, 2015, 32, 2, p. 287-310, https://doi.org/10.3166/TS.32.287-310 -
dc.identifier.issn 0765-0019 -
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/2042/70276
dc.description.abstract En imagerie cellulaire, et plus particulièrement en microscopie de fluorescence, la première phase de beaucoup d’analyses consiste à détecter des éléments intra-cellulaires d’intérêt, comme des protéines ou des vésicules. De nombreuses méthodes de détection ont été développées dans ce contexte, mais elles réclament souvent un paramétrage assez fin et ne peuvent pas toujours s’adapter à l’échelle des éléments à détecter. Nous proposons une méthode incluant une sélection d’échelle automatique précise et un seuillage localement adapté. La méthode fournit de plus le support spatial effectif des éléments détectés, qui ne sont pas nécessairement circulaires. Des expérimentations quantitatives sur images simulées montrent les avantages et les meilleures performances de notre méthode. Des résultats sur séquences réelles confirment son intérêt. fr
dc.description.abstract In live cell and fluorescence microscopy, the first step of the analysis often consists in detecting a large amount of elements (molecules, vesicles). Many detection methods have been developed to this purpose, but they often need a fine tuning stage and cannot automatically fit the object scale. We propose a detection method with an accurate automatic scale selection and a locally adapted thresholding. Moreover, the method provides the spatial support of the detected elements, which are not necessarily circular. Quantitative experiments on synthetic sequences demonstrate the advantages and better performance of our method. Its interest is confirmed by results on real sequences. en
dc.language.iso fr -
dc.publisher Lavoisier -
dc.relation.ispartofseries Traitement du signal -
dc.rights Accès libre - Licence d'utilisation : http://irevues.inist.fr/utilisation -
dc.source Traitement du signal [Trait. Signal], ISSN 0765-0019, 2015, 32, 2, p. 287-310 -
dc.subject microscopie TIRF fr
dc.subject détection, sélection d’échelle fr
dc.subject seuillage adaptatif. fr
dc.subject TIRF microscopy en
dc.subject detection, scale selection en
dc.subject adaptive thresholding en
dc.title Détection de spots avec sélection d’échelle automatique et seuillage adaptatif en microscopie de fluorescence fr
dc.title.alternative Spot detection with automatic scale selection and adaptive thresholding in fluorescence microscopy en
dc.type Article -
dc.contributor.affiliation Inria, Centre Rennes Bretagne Atlantique, Campus Universitaire de Beaulieu 35042 Rennes Cedex -
dc.contributor.affiliation CNRS, Institut Curie, UMR 144, 12 rue Lhomond, 75005 Paris -
dc.identifier.doi https://doi.org/10.3166/TS.32.287-310


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