Un aperçu général des infections bactériennes chez les poissons d'élevage est d'abord présenté: espèces bactériennes en cause, facteurs favorisants, types d'infection, modes de transmission, et méthodes de lutte. Les études menées par l'INRA sur le principal pathogène bactérien des salmonidés dans le monde, Flavobacterium psychrophilum, sont ensuite passées en revue. Après les techniques de culture, d'identification et de typage moléculaire des souches, un modèle expérimental reproductible de la maladie sur la truite arc-en-ciel a été mis au point. Les études moléculaires ont considérablement affiné la taxonomie et la phylogénie de l'ensemble de la famille des Flavobacteriaceae. Le génome complet d'une souche de F. psychrophilum vient d'être séquencé. Son analyse a déjà révélé de nombreux gènes impliqués dans le mode de vie de la bactérie, en particulier dans sa virulence pour l'hôte....

La biologie de l'ovocyte et de l'embryon canins, qui présentent des particularités spécifiques, est très mal connue. La chienne se distingue principalement par les modalités de reprise de la méiose ovocytaire : celle-ci n'a pas lieu au moment de l'ovulation, comme chez les autres femelles mammifères, mais dans l'oviducte 48 à 60 heures après l'ovulation. Les facteurs responsables de ce retard ne sont pas connus. Ceci explique sans doute pourquoi les taux de maturation in vitro obtenus à l'heure actuelle sont faibles (10 à 30 %). La collecte des ovocytes est aussi un facteur limitant majeur, en l'absence de protocole efficace d'induction des cycles et de superovulation. Les rendements de fécondation in vitro sont également faibles (10 %), avec un taux élevé de polyspermie. À l'heure actuelle, aucun chiot n'est encore né à partir d'un embryon produit in vitro. Quant aux embryons produits in vivo, leur collecte est difficile pour des raisons anatomiques et le rendement est limité par l'impossibilité d'induire des superovulations; par ailleurs, leur transfert chez des femelles receveuses se heurte aux difficultés de synchronisation des ovulations entre la femelle donneuse et les receveuses, et la littérature ne décrit que six essais, qui ont abouti à la naissance de 45 chiots. Avec un très faible recours à la culture in vitro, quatre naissances de chiots ont été obtenues par clonage de cellules somatiques. Les biotechnologies de la reproduction sont donc largement en retard dans l'espèce canine, qui souffre d'un manque de travaux fondamentaux visant à mieux comprendre ses mécanismes physiologiques spécifiques. Ce déficit est d'autant plus dommageable que le chien prend une place croissante et pertinente en tant que modèle biomédical....

La fièvre catarrhale ovine, aussi appelée « bluetongue », est une arbovirose transmise par un moucheron hématophage du genre Culicoïdes. Elle se manifeste cliniquement principalement chez les moutons et se traduit par une infection généralisée et grave. Depuis sa réapparition en Europe en 1998, cinq sérotypes (1, 2, 4, 9 et 16) sur les 24 existants ont été recensés dans de nombreux pays du pourtour méditerranéen. En France, seulement la région Corse a subi quatre épizooties impliquant les sérotypes 2, 4 et 16. En 2006, de façon inattendue, la bluetongue (sérotype 8) a émergé en Belgique, Allemagne, Pays bas, France et au Luxembourg. La symptomatologie associée à cette épizootie a de quoi surprendre, puisque les bovins présentent des signes cliniques de gravité variable, alors que classiquement, le virus de la bluetongue ne provoque que très rarement des manifestations cliniques dans cette espèce. Les caractéristiques de cette épizootie, les méthodes de diagnostic et les moyens prophylactiques seront présentés dans cet article....

On constate un accroissement de la prévalence de la paramphistomose bovine en France. Cette récente réémergence peut être reliée à différents facteurs : le peu d'anthelminthiques spécifiques disponibles, la longévité et la forte prolificité des vers adultes, la chute de la prévalence de Fasciola hepatica permettant la plus grande disponibilité des limnées, hôtes intermédiaires, et enfin l'extensification de l'élevage. En dépit d'une symptomatologie peu spécifique, la pathogénicité de la paramphistomose ne doit pas être ignorée : risques de forme aiguë liée aux vers immatures -difficile à identifier- et de météorisation récurrente par l'effet mécanique des adultes. Cette pathogénicité est néanmoins bien moindre que celle de Fasciola hepatica. Aucun test sérologique n'est actuellement disponible : seul le diagnostic coproscopique avec comptage des oeufs (OPG) vient confirmer la suspicion clinique. Cependant, le niveau des OPG n'est pas formellement corrélé à la charge parasitaire....

Les élevages piscicoles français et européens de truite arc-en-ciel sont confrontés à des infections virales qui tuent annuellement environ le cinquième de leur production (soit 10.000 tonnes pour la France, 23 millions d'Euros par an). Les principales viroses sont provoquées par deux rhabdovirus qui coexistent: le virus de la septicémie hémorragique virale, vSHV, et le virus de la nécrose hématopoïétique infectieuse, vNHI. Les rhabdovirus, dont le prototype le plus connu est le virus de la rage, ont un génome constitué d'une molécule d'ARN de polarité négative d'environ 12 kilobases (kb). Ces maladies virales sont les plus fréquentes mais l'intensification des élevages de salmonidés et le développement de l'élevage d'autres espèces entraînent l'apparition de pathologies nouvelles et, aussi, une augmentation de l'incidence des pathologies anciennes. L'un des exemples le plus notable de ces dernières années est certainement la maladie du sommeil des salmonidés, connue depuis les années 1980, présente dans la plupart des pays européens et sur le continent Nord américain. Jusqu'alors peu fréquente dans les élevages piscicoles français, elle affecte maintenant 30-40 % de ces élevages. Le virus responsable ou virus de la maladie du sommeil (VMS) appartient à la famille des alphavirus; son génome est une molécule d'ARN de polarité positive de 12 kb. Depuis quelques années, nous focalisons notre activité en partie sur le développement de stratégies vaccinales en manipulant le génome de ces virus, permettant à terme l'utilisation de vaccins vivants, La manipulation génétique des virus à ARN passe obligatoirement par l'aptitude à récupérer le virus à partir d'une copie ADN du génome ARN. C'est ce que l'on appelle « la génétique inverse». La première démonstration de génétique inverse pour un virus à ARN de polarité positive, le poliovirus, date des années 1980, et il a fallu attendre une quinzaine d'années pour qu'il en soit de même pour un virus à ARN de polarité négative, le virus de la rage. Le passage par un intermédiaire ADN artificiel, copie conforme du génome viral à ARN, offre la possibilité de manipuler aisément le génome et, par exemple, d'enlever des gènes pour étudier leur rôle ou bien d'en rajouter pour exprimer des gènes hétérologues. Des systèmes de génétique inverse pour le vNHI et le VMS ont été élaborés au laboratoire et ont permis de générer de nombreux virus recombinants dont certains sont en phase d'expérimentation à grande échelle comme outil vaccinal....